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Un étudiant de ce niveau sera confronté
à la lecture de documents scientifiques rédigés en
anglais et doit être préparé à la
présentation de ses propres travaux dans cette langue. Cette
UE a pour but de le familiariser à la lecture et l'analyse
critique d'articles scientifiques en anglais, principalement dans
le domaine de l'informatique. Il s'agit de permettre l'acquisition
du vocabulaire et des tournures grammaticales employés dans
les publications scientifiques.
Au travers de ces lectures, l'étudiant
enrichira sa culture générale en informatique.
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L'objectif de la formation est de fournir à
l'étudiant les outils méthodologiques pour lire,
comprendre et analyser de manière critique un travail de
recherche décrit dans le format d'une publication en
anglais.
Au début de l'enseignement, chaque
étudiant reçoit un article scientifique dont il devra
comprendre avec précision les tenants et les aboutissants.
Pour mener à bien ce projet, il devra aller quérir les
informations utiles dans les bibliothèques et sur le web
éventuellement guidé par un enseignant. Ce travail
donnera lieu à une présentation en anglais à l'aide
d'un vidéo-projecteur. Les documents seront choisis pour
compléter la formation scientifique reçue.
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Cette UEc est un cours avancé de biologie
post-génomique d'une semaine assimilé à un stage.
Cet enseignement, existant déjà sur le site, est
organisé depuis quelques années par Genopole® dans
le but de former des chercheurs non biologistes aux objets et aux
concepts-clefs de la biologie liés à
l'après-génomique. Genopole® ouvre ce cours aux
étudiants du master IMBI et c'est donc une excellente
opportunité pour ces étudiants de rencontrer des
chercheurs experts dans leur champ d'activité et sensibles
à la problématique de la modélisation en biologie.
Dans chacun des domaines liés à la post-génomique,
il sera en particulier expliqué quels types de questions se
posent, quelles méthodes sont nécessaires pour y
répondre et enfin ce qui est considéré comme un bon
résultat en biologie. L'objectif est de préparer les
étudiants à une activité de recherche dans le
domaine de la modélisation des systèmes biologiques
complexes tels qu'on en rencontre en biologie
moléculaire.
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Génétique moléculaire
- Biologie
Structurale
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Génomique
- Biologie
cellulaire
- Biologie
animale et végétale
-
Introduction à l'évolution
-
Post-génomique
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Cette UEc porte sur la biologie intégrative
et fait suite à un cours de semestre 1 de master. La biologie
intégrative cherche à comprendre les propriétés
du vivant émergeant de l'interaction d'un grand nombre de
processus simultanés et cohérents. Les notions de
réseau et de dynamique des processus sont donc centrales dans
cette approche. Ce module donnera aux étudiants les bases
fondamentales en biologie permettant d'aborder ces notions et les
illustrera de quelques applications concrètes en biologie
cellulaire.
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Réseaux « Small Worlds ».
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Réseaux booléens. Le modèle synchrone et asynchrone
de R. Thomas (application à l'épigénèse).
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Energétique des réseaux.
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Dynamiques complexes. « Self-Organised
Criticality ».
- Chaos
déterministe.
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Processus physico-chimiques de l'intégration ;
applications :
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Dynamique du calcium chez les eucaryotes.
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Biologie intégrative du cycle cellulaire bactérien.
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Organisation dynamique du noyau eucaryote.
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