2.1 UEs obligatoires
ASA : Analyse d'articles Scientifiques en Anglais Biologie Intégrative
ASA : Analyse d'articles Scientifiques en Anglais
Objectif
Un étudiant de ce niveau sera confronté à la lecture de documents scientifiques rédigés en anglais et doit être préparé à la présentation de ses propres travaux dans cette langue. Cette UE a pour but de le familiariser à la lecture et l'analyse critique d'articles scientifiques en anglais, principalement dans le domaine de l'informatique. Il s'agit de permettre l'acquisition du vocabulaire et des tournures grammaticales employés dans les publications scientifiques.
Au travers de ces lectures, l'étudiant enrichira sa culture générale en informatique.
Contenu
L'objectif de la formation est de fournir à l'étudiant les outils méthodologiques pour lire, comprendre et analyser de manière critique un travail de recherche décrit dans le format d'une publication en anglais.
Au début de l'enseignement, chaque étudiant reçoit un article scientifique dont il devra comprendre avec précision les tenants et les aboutissants. Pour mener à bien ce projet, il devra aller quérir les informations utiles dans les bibliothèques et sur le web éventuellement guidé par un enseignant.  Ce travail donnera lieu à une présentation en anglais à l'aide d'un vidéo-projecteur. Les documents seront choisis pour compléter la formation scientifique reçue. 
Horaires
Cours
TD
TP
   0
    21
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Biologie Intégrative
SIAB : Stage d’Introduction avancée à la biologie post-génomique
Objectif
Cette UEc est un cours avancé de biologie post-génomique d'une semaine assimilé à un stage. Cet enseignement, existant déjà sur le site, est organisé depuis quelques années par Genopole® dans le but de former des chercheurs non biologistes aux objets et aux concepts-clefs de la biologie liés à l'après-génomique. Genopole® ouvre ce cours aux étudiants du master IMBI et c'est donc une excellente opportunité pour ces étudiants de rencontrer des chercheurs experts dans leur champ d'activité et sensibles à la problématique de la modélisation en biologie. Dans chacun des domaines liés à la post-génomique, il sera en particulier expliqué quels types de questions se posent, quelles méthodes sont nécessaires pour y répondre et enfin ce qui est considéré comme un bon résultat en biologie. L'objectif est de préparer les étudiants à une activité de recherche dans le domaine de la modélisation des systèmes biologiques complexes tels qu'on en rencontre en biologie moléculaire.
Contenu
  • Génétique moléculaire
  • Biologie Structurale
  • Génomique
  • Biologie cellulaire
  • Biologie animale et végétale
  • Introduction à l'évolution
  • Post-génomique
Horaires
Cours
TD
TP
   21
    0
   0
Biologie Intégrative II
Objectif
Cette UEc porte sur la biologie intégrative et fait suite à un cours de semestre 1 de master. La biologie intégrative cherche à comprendre les propriétés du vivant émergeant de l'interaction d'un grand nombre de processus simultanés et cohérents. Les notions de réseau et de dynamique des processus sont donc centrales dans cette approche. Ce module donnera aux étudiants les bases fondamentales en biologie permettant d'aborder ces notions et les illustrera de quelques applications concrètes en biologie cellulaire.
Contenu
  • Réseaux « Small Worlds ».
  • Réseaux booléens. Le modèle synchrone et asynchrone de R. Thomas (application à l'épigénèse).
  • Energétique des réseaux.
  • Dynamiques complexes. « Self-Organised Criticality ».
  • Chaos déterministe.
  • Processus physico-chimiques de l'intégration ; applications :
        - Dynamique du calcium chez les eucaryotes.
        - Biologie intégrative du cycle cellulaire bactérien.
        - Organisation dynamique du noyau eucaryote.  
Horaires
Cours
TD
TP
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